初登场·黑暗组织的剧场版
电梯的缆线断裂的爆破场面、配电室的破坏所引发的停电、切换自己发电等壮观场面的创作构想是本剧的重点。这次也是少年侦探队的大活跃！黑衣组织也隆重剧场初登场！青山老师在原作里[Vol.34]让黑衣组织出场！这是继青山老师在漫画中让基德下战帖，帮忙为「世纪末的魔术师」下伏笔之后，第二次帮电影衔接剧情。终于那些家伙全员出动，看不见出口的杀人游戏，现在，终于开始……危险的陷阱让时间陷入停止。那些黑衣人的背后拥有凶恶的阴谋，这些家伙目的到底为何？以距离地面300km高的摩天大楼为死亡舞台，魔鬼般的手正在暗处悄悄伸向柯南！……
被盯上了的双塔摩天大楼
少年侦探团在露营途中路过一座标高分别为319米和294米的且将在近期完工的全日本最高双塔摩天大楼，对此感兴趣的少年侦探团便决定露营结束后参观。露营当晚，元太无意撞见小哀在打电话：“露营结束后会去双塔摩天大楼，当然，他也会同行”，与此同时，黑衣组织将目标也锁定为这座摩天大楼，难道……
机器故障 or 人间蒸发
露营结束后，为打发时间，少年侦探团玩起读30秒游戏，步美丝毫不差的读了出来。到达最高双塔摩天大楼的少年侦探团，遇见被邀请参加开幕典礼的小五郎与小兰。一行人在秘书泽口的带领之下开始参观这座高科技双塔摩天大楼，途中程序员原先生带领柯南一行人玩起预测十年后长相的机器，小兰的十年后长相令柯南脸红不已，而园子则决定换个发型。被强推上去的小哀和柯南因机器问题而躲过一劫，是否真如小哀所说，其实十年后都不在了?!
黑色的罪恶之手已在悄悄接近
在大楼所有者常盘美绪的介绍下，他们认识以画富士山闻名的画师如月峰水、市议员大木岩松、双塔的设计者风间英彦也是森谷帝二的弟子，那这栋大楼……常盘美绪继续介绍着，A栋白天晚上都可以看到富士山，B栋楼顶是游泳池，因地基原因无法一样高。此时，柯南得知琴酒的保时捷停在楼下，便追了出去……
其乐融融的参观之旅却碰上了
光彦、步美找到小兰谈心。步美讲起自己对柯南的喜欢，光彦则是喜欢上步美和小哀了?！少年时纯纯的爱，萌化了观众们心，也让侦探团的形象倍感鲜活。与光彦、步美谈完心的小兰，与新一打着电话。“柯南好像喜欢上我了”“才没有了，笨蛋”忙着解释的柯南同学，也会说出很有道理的话，“那就不要欺骗自己要诚实的面对自己，就能找到答案了！”只是，荨麻疹一般的爱意，真的不用在意吗？
NO.1杀人事件发生
当晚，第一个杀人事件发生了，柯南一行人因此到警局侦讯。少年侦探团也展开调查，但小哀缺席，不禁想象她在深夜里究竟是在跟谁联络。而柯南的真正身份会被那些家伙发现吗?且灰原哀真正的身份又是？调查第二天，原先生遇害，接下来还会有人遇害吗？应阿笠博士要求，当晚柯南留宿，切断小哀与其姐姐公寓的电话，让小哀十分伤心，感到倍感孤独。而另一旁，正在进行窃听的黑衣组织展开了行动……
被监听的宫野家电话·灰原哀
一次两次，总是午夜最深处，灰原独自一人对着电话默默汇报自己的行程。难道一直以来灰原都是组织的间谍？难道灰原会出卖一直帮助自己的众人？还是另有隐情之处……又是一个安静的夜晚，待博士等人都熟睡之后，灰原悄悄爬起，拿起电话，播着一串再熟悉不过的数字，电话的另一头响起了最温暖的声音：“嘟嘟嘟……你好，我是宫野，现在不在家，请在提示音之后留下你的大名和事由……”是什么样的少女如此孤独与寂寞，需要用这短短的10秒钟来填补自己看似坚强实则脆弱的内心？那一瞬间的毫无防备迎来的却是琴酒的守株待兔，灰原在留下自己的留言时完全不曾想到已经带来的威胁——琴酒知道了Sherry的动态。关键时刻，柯南掐断了留言，也切断了组织的追踪，更截断了灰原唯一的安慰。第二天，在灰原冷静过后向柯南坦诚了这样的事实：我也会寂寞我也会害怕，每当这个时候，只想听听姐姐这不到10秒的声音……柯南虽然对灰原抱以鼓励——你可不是一个人，但是灰原消沉的意识并没有恢复，感叹着自己的容身之处在哪里。这时误解了灰原言语的少年侦探团们却用孩子们的天真化解了一切。请牢记，灰原酱，你不是一个人哦！
一个接一个的被害人出现
不顾目暮警官等人的劝说，双塔摩天大楼的开幕典礼仍按照预定进行。园子烫着和小哀一样的波浪头，让柯南再次脸红。开幕典礼时，途中余兴节目又是读30秒，因受干扰的小五郎歪打正着抽中跑车，而步美错失机会。随后，常盘美绪被杀，A栋电机室和发电机室，有着重要资料的电脑室被炸。剧情加快，难道这次的凶手真是泽口？黑衣组织究竟有什么目的？会场开始了紧急撤离，少年侦探团因让出电梯位置被困，决定走60楼联络桥。另一方面，柯南恍然大悟，黑衣组织是狙击酷似雪莉的园子！柯南大吼一声，园子弯腰！嘭！子弹打在了电梯电路板上！虽然救得一命，也消除了琴酒的误会，电梯却停在45楼。当一行人打算通过该层的另一座联络桥跑到B栋时……BOOM！黑衣组织炸掉联络桥！柯南、小兰及少年侦探团，被活活困在A栋！黑衣组织，步步逼近！
只为一个信念
45楼联络桥前，烈火一步步吞噬，小兰缠上消防管抱紧柯南，“小兰姐，你不害怕吗？”“本来很害怕，可是现在有柯南跟我在一起，而且新一也叫我等他，我一定要等他回来”“我相信你一定可以”，死都从容不迫，爱怎能无动于衷，纵身一跃，逃离火海。
黑衣组织的目标竟然是
得知少年侦探团被困的柯南，决定用滑板飞跃两栋楼之间的间距，一片叫好的侦探团被柯南支到了楼顶的直升机停机坪，而柯南和灰原却……主会场内，柯南揭穿罪犯的真实面目——画家如月峰水先生。杀人动机是因为大楼将富士山“劈”成了两半，而证据就是其拐杖内的珍珠。至于现场留下的破碎的酒杯，那是象征着被“劈”开的富士山，也正是其愤怒的讯息。可原先生一案的不在场证明又是……？原来原先生手中的银制叉子指的是“银”→“GIN(罗马音)”→“GIN(酒名)”→“琴酒”！原先生入侵过黑衣组织的电脑，因此被杀。黑衣组织因而前来销毁常盘集团主电脑。为了将还没出现的“雪莉”困在楼中，引燃了顶楼的停机坪！无奈，救援直升机因而撤退。而黑衣组织秉承着不被人发现动机的原则，又将主会场也被装满炸弹，最后的高潮戏即刻到来……!!
生死时速·侦探团的大危机
经运算后，柯南决定冒险开车飞跃，少年侦探团也决定轰轰烈烈的做，为把握时机，小哀先在炸弹边倒数，步美再读秒。但小哀却为准确读秒，决定牺牲。通向天国的倒计时开始。元太却抓住小哀，“如果留下一颗米粒，就会被老天惩罚”，飞跃途中，小哀险些掉出，被光彦抓住，在撞向冰柱的一瞬间，被柯南踢碎柱子救下。
我心所爱的《倒计时》
《名侦探柯南M05：通向天国的倒计时》是首次突破30亿日元的柯南系列电影。它以34亿日元创下系列前期新高。同时它也是首部与黑衣组织较量的剧场版，可说是对之后的M13、M20打下了坚实的基础。该片中，汽车飞行的两秒钟里，侦探团的所作所为使用慢格播放长达30秒，可谓给足了镜头！30秒里，是友情的集中体现，是《柯南》全系列宣扬的真、善、美的品质的爆发。甘愿牺牲自我的灰原哀，不丢下任何一粒米的小岛元太，能伸出绝不放开的手的圆谷光彦，以懵懂之心跳在秒钟上的吉田步美，总能化险为夷的江户川柯南，无不浓缩在这危急却又美好的最后30秒——值得所有柯南迷所铭记的30秒！
粉丝眼中的M5
通往天国的倒计时...印象最深刻，小兰说，要活着等新一回来，那一刻，对小兰和新一之间那种深沉而刻骨铭心的爱，感动又羡慕...倒计时的时候，又为灰原感到心酸，因为不想连累朋友而想要自己留下来牺牲，很心疼她，开车冲出去的剧情紧张又刺激，通往天国的倒计时，真的看得很过瘾，是我最喜欢的一部♥! @栠慖惞[微博]我印象比较深的除了哀酱就是元太了，“留下任何一粒米粒都会受到上天的惩罚的！”不管是对米饭还是同伴，有这种简单到不能再简单的善良和勇敢的元太真的瞬间帅炸了! @不太标准的天蝎座[微博]
-特别喜欢M5，当时看的时候觉得少年侦探团那几个小孩可英勇了! @猫袋王爱小鲜鱼[微博]
-同感，M5是剧场版中最喜欢的一部，对小胖子元太印象最深刻了!@echoss[微博]
